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无论在国内调查，还是到国外考察，卢良恕每到一地考察，都必先调来材料，了解所要考察地区的情况，做到“心中有数”，到现场一看一听、一查一问，便能了解新鲜东西，知道深层情况。这样使有限的考察时间不花费在了解基本情况上，而有更多的时间汲取最新的经验，了解更多情况，这是他考察工作事半功倍的方法之一。
卢良恕走遍了全国大部分地区，每到一处他不但能从中了解许多情况，丰富自己的经验宝库，还作过上百场学术报告，为这些地区发展农业生产、振兴农村经济、进行综合开发提出不少好的建议、新的观点，得到了国家有关部委和各级政府的重视和采纳。 1983年，卢良恕到甘肃缺水少雨的干旱地区考察，在谈到中国北方旱地农业战略和措施时提出，发展北方旱地农业的指导思想，应当是从单纯强调旱改水，转向灌溉农业与旱地农业并重，以旱地农业为主；从单纯依靠工程措施，转向工程措施和生物措施相结合，以生物措施为主；山、水、草、林、田综合治理，农、林、牧、副全面发展，同时大力发展旱地农业和节水农业。
1984年，他率领中国农学会组织的山区农业发展综合专家考察组赴贵州考察，他提出，要重点建设开发型和开放型相结合的农业，对内实行全面开发，合理利用资源，对外实行层层开放，把引进技术、资金、人才结合起来；加快发展各种类型的农村工业；要加强农田基本建设，重视坡地改梯田，种草、植树，保护生态环境，实行种植业“食粮－经－饲”三元结构，逐步建立优化的农村产业结构；尽快采取适用的先进配套技术，加速农村各产业部门的技术改造；要全面规划，分类指导。这些意见，得到了省领导的高度重视。
1987年，他在考察海南岛农业后，提出应从海南岛农业资源情况出发，进行综合开发治理，在开发海南岛时，应把自然资源的开发、保护、引进和利用；经济效益和生态效益；当前利益和长远利益等很好地结合起来，使资源不断再生和更新，技术迅速提高，实施产业化经营，农村经济才能欣欣向荣的新思想。
1988年，根据国务院重点开发黄淮海平原的政策，中国农学会受农业部和中国科协委托，由卢良恕亲自主持和组织了农业、水利、林业、畜牧、水产等多学科、跨部门、高层次的50多位专家、教授，召开了多次黄淮海平原农业发展战略研讨会，对这一地区农业综合开发的总体规划草案和五省黄淮海农业开发规划草案进行科学论证，他和十多位专家一起深入冀豫皖三省的重点开发地区实地考察、调研、评估了黄淮海平原到2000年新增2500万吨粮食、100万吨棉花、150万吨油料、200万吨肉类的生产潜力和可行性，对实施这四项指标的布局、商品基地建立、投资管理使用、科技投入以及扶持政策等重大问题提出了具体建议，被国家采纳，把该区域列入了“八五”重点商品粮生产基地，取得了显著成果。
1989年，卢良恕二上甘肃河西走廊考察，他认为，河西作为“强东拓西”的重要纽带，在甘肃乃至西北部地区发展中有特殊地位，建议在该地区分期分批建立粮食作物、经济作物、名特优水果基地。
主持的“中国粮食与经济作物发展综合研究”获农村社会经济发展优秀成果一等奖和国家科技进步二等奖。主持的国家自然科学基金会重大研究项目“中国长期食物发展战略研究”，从营养水平、食物生产、食物流通、食物消费、物质投入、科技进步及地区发展方面，跨度1995年、2000年、2020年三个时期对食物发展进行了系统研究。该项目的阶段性成果已为国家有关计划管理部门所采用，并推动了全国食物结构的研究工作。先后发表了有关小麦遗传育种、耕作栽培技术、农业区域综合开发、科技进步与农业现代化、中国食物发展战略研究等140多篇科学论文，调研报告和综述性文章。
曾主持选育早熟、抗锈、丰产的“华东6号”等系列小麦优良品种，推动了中国长江中下游地区小麦生产。主持的“中国农业现代化的理论道路和模式”等多项重大农业宏观战略课题，其中两项获国家科技进步奖。创造性提出“现代集约持续农业”、“食物安全”、“种植业三元结构”等重要战略观点，在高层次决策咨询中发挥了重要作用。立足区域协调发展，关注沿海发达地区、资源“金三角”、黄土高原、西部贫困地区等区域农业综合开发，取得突出成效。已发表学术论文200多篇，有《长江下游小麦地方品种研究》、《南方小麦增产的主要技术问题》、《中国农业与粮食生产的现状和发展前景》、《我国农业科学事业的成就和发展战略设想》等，出版主编和专著10余部。曾荣获1998年度“中国工程科技奖”及2001年中国老科协“科技耆英奖”。
1994年当选为中国工程院院士。
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